33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0619 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  296  6e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  37.5 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2668  protein of unknown function DUF1486  35.77 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000361014  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  28.68 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.97 
 
 		 316 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3428  limonene-1,2-epoxide hydrolase  30.08 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  27.61 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  30.65 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2313  hypothetical protein  31.82 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2282  hypothetical protein  42.25 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182969  normal  0.14017 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  28.85 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  28.97 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  30.22 
 
 		 185 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  25.93 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  30.77 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3271  hypothetical protein  27.14 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  26.81 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4057  protein of unknown function DUF1486  32.35 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.846215  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0110  hypothetical protein  28.97 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  30.85 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  27.08 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  27.16 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  31.91 
 
 		 182 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  28.75 
 
 		 137 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  23.62 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1177  protein of unknown function DUF1486  31.75 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.266373  normal  0.621236 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  25.36 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  30.69 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  24.81 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  30.4 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  27.14 
 
 		 185 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  27.2 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>