21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1105 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1105  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  642    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2241  hypothetical protein  58.71 
 
 
344 aa  326  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02563  hypothetical protein  39.79 
 
 
331 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1360  protein of unknown function DUF1486  40.71 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.602593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3702  hypothetical protein  39.15 
 
 
331 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0491552  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2464  hypothetical protein  34.33 
 
 
338 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0611  hypothetical protein  33.09 
 
 
338 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04814  hypothetical protein  33.09 
 
 
338 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2641  hypothetical protein  30.72 
 
 
332 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.0276572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1417  protein of unknown function DUF1486  36.3 
 
 
174 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289435  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2638  hypothetical protein  34.72 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0108071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.63 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  41.3 
 
 
185 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  41.3 
 
 
185 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  40 
 
 
182 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  29.69 
 
 
212 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  43.48 
 
 
185 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  43.48 
 
 
185 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  43.48 
 
 
185 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  45.65 
 
 
187 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>