11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2464 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0611  hypothetical protein  88.76 
 
 		 338 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04814  hypothetical protein  90.83 
 
 		 338 aa  665    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2464  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  712    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1360  protein of unknown function DUF1486  53.45 
 
 		 345 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.602593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3702  hypothetical protein  30.86 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0491552  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02563  hypothetical protein  30.25 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1105  hypothetical protein  34.33 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2241  hypothetical protein  31.79 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2641  hypothetical protein  28.57 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.0276572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1417  protein of unknown function DUF1486  27.22 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2638  hypothetical protein  27.22 
 
 		 174 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0108071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>