13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2241 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2241  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  692    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1105  hypothetical protein  56.59 
 
 		 319 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02563  hypothetical protein  40.67 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3702  hypothetical protein  37.39 
 
 		 331 aa  195  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0491552  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1360  protein of unknown function DUF1486  34.43 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.602593 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2464  hypothetical protein  30.5 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2641  hypothetical protein  36.1 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.0276572 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04814  hypothetical protein  29.79 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0611  hypothetical protein  30.29 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1417  protein of unknown function DUF1486  32.54 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2638  hypothetical protein  30.95 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0108071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.64 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  31.53 
 
 		 139 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>