12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1360 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1360  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 345 aa  704    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.602593 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04814  hypothetical protein  54.05 
 
 		 338 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0611  hypothetical protein  53.61 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2464  hypothetical protein  53.45 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3702  hypothetical protein  37.8 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0491552  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1105  hypothetical protein  37.65 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02563  hypothetical protein  34.81 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2241  hypothetical protein  34.43 
 
 		 344 aa  156  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2641  hypothetical protein  32.63 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.0276572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1417  protein of unknown function DUF1486  29.09 
 
 		 174 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2638  hypothetical protein  28.48 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0108071 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  34.48 
 
 		 140 aa  42.7  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>