60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7231 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
149 aa  306  6.999999999999999e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3746  hypothetical protein  61.07 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  35.2 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  33.6 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  32.28 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  30.51 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  29.41 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  29.41 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  29.41 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  29.41 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  29.45 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  29.37 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  29.45 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  27.94 
 
 
182 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  29.69 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  27.94 
 
 
179 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  27.94 
 
 
179 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  31.03 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  25.4 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  26.27 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  24.06 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  22.58 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  25 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  27.66 
 
 
148 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.89 
 
 
316 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  27.19 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  28.32 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  24.06 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  21.37 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  22.76 
 
 
132 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  26.13 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  23.48 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  28.7 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  23.58 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  23.48 
 
 
214 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  23.58 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  29.09 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  22.39 
 
 
212 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  21.88 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  25.49 
 
 
212 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  23.58 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  24.76 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  22.88 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  24.11 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  32.14 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  23.39 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  23.48 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  24.79 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  23.58 
 
 
180 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  25 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  26.73 
 
 
173 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  22.22 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  27.01 
 
 
284 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3702  hypothetical protein  30.86 
 
 
331 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0491552  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  23.08 
 
 
214 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  22.31 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  21.09 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  21.88 
 
 
185 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  21.88 
 
 
185 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  22.46 
 
 
185 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>