65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0996 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
173 aa  352  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  34.09 
 
 
142 aa  83.6  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  35.66 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  36 
 
 
186 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  40.26 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  27.69 
 
 
146 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  28.46 
 
 
146 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  35 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  36.25 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  37.04 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  35.8 
 
 
212 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  29.76 
 
 
187 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  37.84 
 
 
185 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  37.84 
 
 
185 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  37.84 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  37.84 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  35.11 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  32.32 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  26.37 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  30.3 
 
 
138 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  30.84 
 
 
148 aa  52  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  36.89 
 
 
144 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  25.82 
 
 
179 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  30.28 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  25.27 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  27.86 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  25.27 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  35.44 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  25.27 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  25.27 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  27.78 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  32.73 
 
 
141 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  31.96 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  27.86 
 
 
137 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  23.63 
 
 
179 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  32.5 
 
 
214 aa  48.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  25.27 
 
 
179 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  26.24 
 
 
131 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  25.93 
 
 
181 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0524  hypothetical protein  35.82 
 
 
135 aa  47.8  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  24.73 
 
 
179 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  26.72 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  30.34 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  24.73 
 
 
182 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3746  hypothetical protein  20.9 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  34.67 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  27.93 
 
 
140 aa  45.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  28.26 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  28.07 
 
 
204 aa  44.7  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  28.24 
 
 
134 aa  44.3  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  26.73 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  31.18 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  28.79 
 
 
137 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  31.25 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  24.73 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  26.15 
 
 
137 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  34.12 
 
 
149 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  31.71 
 
 
138 aa  40.8  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>