72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6186 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
146 aa  300  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  73.79 
 
 
146 aa  228  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  35.2 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3746  hypothetical protein  32.54 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  32.26 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  32.28 
 
 
179 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  32.28 
 
 
182 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  31.71 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  29.1 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  31.5 
 
 
179 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  32.03 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  34.74 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  28.46 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  29.92 
 
 
179 aa  57.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  25.95 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  34.04 
 
 
181 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  30.77 
 
 
182 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  31.9 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  29.03 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  29.92 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  28 
 
 
187 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  29.13 
 
 
179 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  25.19 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  27.64 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  25.6 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  32.65 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  32.65 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  28.03 
 
 
137 aa  52  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  38.96 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  32.58 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  26.89 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  28.91 
 
 
179 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  28.91 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  29.77 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  28.87 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  32.95 
 
 
212 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  28.87 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  32.65 
 
 
214 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  26.77 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  25.53 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  29.73 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  22.22 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  30.26 
 
 
185 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  30.26 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  30.26 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  30.26 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  30.26 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  30.26 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  30.26 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  29.47 
 
 
214 aa  47.4  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  30.67 
 
 
186 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  21.55 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  23.66 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  31.82 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  25.25 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  23.53 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  30.38 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  20.59 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  23.93 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  28.77 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  26.62 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  23.53 
 
 
145 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  23.58 
 
 
128 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  23.58 
 
 
128 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  23.58 
 
 
128 aa  40.8  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  26.85 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  31.82 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  27.55 
 
 
173 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  29.73 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  26.92 
 
 
132 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  23.57 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  25.66 
 
 
284 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>