52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4917 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  304  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4924  hypothetical protein  82.99 
 
 
155 aa  258  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0317  protein of unknown function DUF1486  82.19 
 
 
153 aa  249  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478711 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  78.91 
 
 
155 aa  248  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5713  protein of unknown function DUF1486  80.14 
 
 
153 aa  245  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  34.9 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  28.57 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  32.61 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  34.04 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  32.88 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  33.96 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  31.03 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  32.52 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  35.25 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.65 
 
 
316 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  30.61 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  27.27 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  25.17 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  30.61 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  30.61 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  29.93 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  32.89 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  31.76 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  28.28 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  30.39 
 
 
182 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  30.39 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  35 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  29.41 
 
 
179 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  31 
 
 
179 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  30.08 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  26.53 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  26.53 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  29.66 
 
 
187 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  28.43 
 
 
182 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  31.47 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  37.08 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  32 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  36.08 
 
 
204 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26927  predicted protein  27.59 
 
 
242 aa  44.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00169388  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  29.8 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  30 
 
 
179 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  37.35 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
402 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  35.35 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  26.47 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  26.47 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  29 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  34.12 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0873  hypothetical protein  28.91 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148799  normal  0.837845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  36.05 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>