42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1039 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
144 aa  303  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4245  hypothetical protein  37.96 
 
 
176 aa  103  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2282  hypothetical protein  33.58 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182969  normal  0.14017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3428  limonene-1,2-epoxide hydrolase  29.41 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  31.88 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2313  hypothetical protein  27.21 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3271  hypothetical protein  29.1 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1177  protein of unknown function DUF1486  26.06 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.266373  normal  0.621236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  33.08 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  30.83 
 
 
129 aa  53.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  28.46 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  29.6 
 
 
128 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  23.13 
 
 
402 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  34.62 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  28.07 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  29.32 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4917  hypothetical protein  35 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  31.16 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5449  hypothetical protein  33.02 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4572  protein of unknown function DUF1486  28.26 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  28.77 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  28.77 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  28.77 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4924  hypothetical protein  34 
 
 
155 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2735  hypothetical protein  29.63 
 
 
195 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.513842  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  25 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  28.45 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  27.68 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  26.57 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  25.2 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  24.37 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  27.82 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0317  protein of unknown function DUF1486  33 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2668  protein of unknown function DUF1486  26.73 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000361014  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  24.26 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  28.89 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1379  hypothetical protein  38.1 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.13329 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2571  protein of unknown function DUF1486  32.5 
 
 
189 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4057  protein of unknown function DUF1486  31.25 
 
 
187 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.846215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  24.29 
 
 
144 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>