37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5410 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5410  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 163 aa  333  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.691604  normal  0.630541 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1198  hypothetical protein  89.57 
 
 		 159 aa  298  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198926  normal  0.424517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1127  hypothetical protein  75.78 
 
 		 157 aa  248  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4693  hypothetical protein  74.84 
 
 		 157 aa  243  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146781  normal  0.148088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3674  hypothetical protein  74.84 
 
 		 157 aa  243  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168299  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5607  hypothetical protein  74.84 
 
 		 157 aa  243  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5328  hypothetical protein  68.55 
 
 		 157 aa  225  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0131441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3555  hypothetical protein  71.34 
 
 		 156 aa  222  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.159937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0979  hypothetical protein  68.67 
 
 		 157 aa  222  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1261  hypothetical protein  67.11 
 
 		 174 aa  221  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0978  hypothetical protein  63.23 
 
 		 158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0971  hypothetical protein  63.23 
 
 		 158 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4245  hypothetical protein  65.36 
 
 		 156 aa  213  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1010  hypothetical protein  62.58 
 
 		 158 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  66.67 
 
 		 160 aa  208  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1079  hypothetical protein  68.87 
 
 		 163 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1255  hypothetical protein  66.01 
 
 		 160 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2583  hypothetical protein  45.45 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2797  hypothetical protein  47.71 
 
 		 156 aa  162  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0482  hypothetical protein  49.08 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3730  hypothetical protein  44.51 
 
 		 171 aa  134  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0347674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6429  hypothetical protein  44.08 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1448  hypothetical protein  43.59 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4477  hypothetical protein  45.96 
 
 		 174 aa  114  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl176  hypothetical protein  33.86 
 
 		 150 aa  97.4  7e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  26.76 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  29.32 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0546  hypothetical protein  27.43 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000563714  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  33.07 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  33.86 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  33.07 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18301  transcription regulator  28.7 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1060  protein of unknown function DUF1486  29.17 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.148569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4737  hypothetical protein  25.93 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.870255  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3840  hypothetical protein  28.69 
 
 		 170 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223195  normal  0.195443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2713  transcriptional regulator-related protein  21.32 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1070  hypothetical protein  26.4 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>