45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3504 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  266  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  70.16 
 
 
128 aa  186  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  69.11 
 
 
128 aa  183  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  61.11 
 
 
131 aa  167  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  59.5 
 
 
139 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  53.6 
 
 
133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  51.2 
 
 
134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  54.55 
 
 
136 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  51.59 
 
 
132 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  59.09 
 
 
136 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  56.14 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  58.56 
 
 
128 aa  130  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  53.51 
 
 
140 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  53.57 
 
 
134 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  52.07 
 
 
132 aa  124  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  50.88 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  51.38 
 
 
120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  49.17 
 
 
135 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0138  hypothetical protein  47.58 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652992  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  31.4 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  30.83 
 
 
144 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  27.56 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5586  protein of unknown function DUF1486  35.19 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  29.75 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1031  hypothetical protein  30.17 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95008  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  38.1 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  38.1 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  38.1 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1405  protein of unknown function DUF1486  29.41 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4572  protein of unknown function DUF1486  27.12 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  33.65 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5664  protein of unknown function DUF1486  29.84 
 
 
257 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4546  hypothetical protein  30.36 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00100705  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3519  hypothetical protein  30.09 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1443  hypothetical protein  31.82 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  25 
 
 
138 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2282  hypothetical protein  30.21 
 
 
144 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182969  normal  0.14017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  24.81 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  28.69 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  28.3 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  28.3 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  28.3 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13800  hypothetical protein  34.74 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.31421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  25.51 
 
 
176 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  27.68 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>