18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4057 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4057  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 187 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.846215  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2735  hypothetical protein  66.67 
 
 		 195 aa  244  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.513842  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2571  protein of unknown function DUF1486  61.75 
 
 		 189 aa  238  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1308  hypothetical protein  48.75 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2668  protein of unknown function DUF1486  50 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000361014  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0645  hypothetical protein  43.97 
 
 		 145 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.272642  normal  0.0449232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  33.09 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1043  hypothetical protein  35.83 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  38.71 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4245  hypothetical protein  31.67 
 
 		 176 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4029  hypothetical protein  22.22 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2393  hypothetical protein  23.24 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000832802  normal  0.0699351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  34.13 
 
 		 138 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  31.87 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  32.35 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  24.06 
 
 		 138 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  32.47 
 
 		 152 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  36.36 
 
 		 123 aa  40.8  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>