71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1179 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 153 aa  313  4e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  51.49 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4153  hypothetical protein  35.94 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  28.46 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  30.3 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  28.33 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  26.09 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1595  hypothetical protein  22.48 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000510897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  27.82 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  26.98 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  28.8 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  26.23 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  29.51 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.91 
 
 		 316 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  28.8 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  29.51 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  29.13 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  30.08 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  27.78 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  28.79 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  28.79 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  29.13 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  28.69 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  36 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  29.32 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  26.36 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2716  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  38.78 
 
 		 410 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  26.4 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  29.32 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  41.86 
 
 		 409 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  27.91 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  27.82 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  24.81 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2641  hypothetical protein  28.24 
 
 		 176 aa  43.9  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0292741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  26.67 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  40.82 
 
 		 411 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  27.82 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  26.23 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  27.82 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  32.86 
 
 		 408 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  26.4 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05376  conserved hypothetical protein  37.78 
 
 		 412 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.964155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0110  hypothetical protein  37.21 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1391  hypothetical protein  34 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1605  hypothetical protein  34 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  25.38 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  29.31 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  39.53 
 
 		 413 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  25 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  36.73 
 
 		 409 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  36.73 
 
 		 415 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  36.73 
 
 		 415 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  39.53 
 
 		 413 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  36.73 
 
 		 415 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  36.73 
 
 		 415 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  39.02 
 
 		 433 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3428  limonene-1,2-epoxide hydrolase  26.12 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  26.36 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  24.51 
 
 		 407 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  36.73 
 
 		 409 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  28.69 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  29.41 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  34.92 
 
 		 407 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  32.86 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07139  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_4G03730)  39.53 
 
 		 499 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.167964 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2313  hypothetical protein  29.55 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  37.21 
 
 		 420 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07470  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_2G05810)  39.53 
 
 		 430 aa  40.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.507136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  46.67 
 
 		 135 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3271  hypothetical protein  29.27 
 
 		 142 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>