21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6124 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  288  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  36.67 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6461  hypothetical protein  38.93 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  34.56 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  32.14 
 
 
141 aa  58.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  26.24 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  36.07 
 
 
153 aa  52  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  26.24 
 
 
151 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2083  hypothetical protein  29.32 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  33.83 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4177  hypothetical protein  26.15 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  28.07 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  31.94 
 
 
194 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  29.89 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  25.55 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  29.37 
 
 
141 aa  43.5  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1709  hypothetical protein  32.26 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  29.29 
 
 
131 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  28.89 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4344  hypothetical protein  28.15 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  27.13 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>