32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1346 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  286  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  51.11 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  50.37 
 
 		 151 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  46.83 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  36.72 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  38.52 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  40.48 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6461  hypothetical protein  34.92 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  36.21 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  30.33 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  36.67 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  35.51 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  40 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  33.04 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  30.48 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5298  hypothetical protein  35.61 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1957  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  29.2 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  33.05 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1709  hypothetical protein  30.34 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2083  hypothetical protein  29.5 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4177  hypothetical protein  22.12 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4686  hypothetical protein  26.98 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  26.57 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  36.8 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3385  phenazine biosynthesis protein  25.69 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39970  phenazine biosynthesis protein  25.69 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4484  hypothetical protein  32.77 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.320998  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2053  nuclear transport factor 2  27.34 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09480  phenazine biosynthesis protein  25.69 
 
 		 162 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>