15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1957 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1957  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  55.56 
 
 		 194 aa  210  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4686  hypothetical protein  29.29 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  31.3 
 
 		 141 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  31.78 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  26.83 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  27.27 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  26.42 
 
 		 131 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5298  hypothetical protein  30.7 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  27.27 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3733  hypothetical protein  25.81 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  31.73 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4177  hypothetical protein  25 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>