26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3023 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  306  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  98.67 
 
 
151 aa  301  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  97.69 
 
 
131 aa  259  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  51.11 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  43.2 
 
 
153 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  36.21 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  38.17 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  32.77 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  31.25 
 
 
171 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  28.7 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6461  hypothetical protein  31.62 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  28.21 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3733  hypothetical protein  29.17 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  26.24 
 
 
143 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1709  hypothetical protein  26.8 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  33.59 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1957  hypothetical protein  27.27 
 
 
182 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  25 
 
 
194 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4177  hypothetical protein  20.47 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  28.57 
 
 
134 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2261  hypothetical protein  23.53 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  30.33 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2083  hypothetical protein  26.95 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  29.69 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>