22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1487 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  100 
 
 
171 aa  356  8e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  37.61 
 
 
131 aa  70.5  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  30.33 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  37.17 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  28.69 
 
 
141 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  31.25 
 
 
131 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  31.25 
 
 
151 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  31.25 
 
 
151 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  34 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  29.84 
 
 
153 aa  55.1  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  35.59 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6461  hypothetical protein  28.57 
 
 
144 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  33.03 
 
 
141 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4686  hypothetical protein  31.58 
 
 
148 aa  48.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4177  hypothetical protein  28 
 
 
134 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  26.9 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  26.45 
 
 
143 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  26.79 
 
 
125 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3220  hypothetical protein  30.91 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4940  hypothetical protein  30.91 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  39.29 
 
 
194 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>