29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20960 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  100 
 
 		 141 aa  291  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  40.8 
 
 		 141 aa  97.1  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  38.52 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  35.11 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  36.21 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  34.48 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  34.48 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  34.82 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  32.06 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  32.82 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  36.11 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  33.85 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  28.69 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1957  hypothetical protein  31.3 
 
 		 182 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3733  hypothetical protein  31.9 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  26.55 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4177  hypothetical protein  30.17 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6461  hypothetical protein  31.86 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  26.09 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5298  hypothetical protein  35.34 
 
 		 135 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  25.55 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  31.25 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5028  Phenazine biosynthesis protein A/B  30.49 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.725966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1568  phenazine biosynthesis protein A/B  28.57 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108852  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  22.64 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39970  phenazine biosynthesis protein  35.06 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09480  phenazine biosynthesis protein  35.06 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3385  phenazine biosynthesis protein  35.06 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2083  hypothetical protein  26.92 
 
 		 155 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>