31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5173 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  36.97 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  40.48 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  35.37 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6461  hypothetical protein  36.72 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  33.67 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  34.17 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  36.11 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  32.77 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  31.93 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  31.93 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  36.84 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  34.56 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  32.74 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  34.07 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  34 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3733  hypothetical protein  29.57 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2083  hypothetical protein  29.53 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1709  hypothetical protein  31.78 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5298  hypothetical protein  31.06 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406321  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0736  hypothetical protein  27.56 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  29.09 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  34.67 
 
 		 287 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0917  hypothetical protein  27.87 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000348146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0991  hypothetical protein  27.56 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00914554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  33.67 
 
 		 194 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0922  hypothetical protein  26.77 
 
 		 133 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56602e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4455  hypothetical protein  29.84 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00728283  normal  0.540789 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0723  hypothetical protein  26.77 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000344598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0880  hypothetical protein  29.03 
 
 		 133 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4686  hypothetical protein  29.82 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>