27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3054 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  306  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  98.67 
 
 
151 aa  301  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  99.24 
 
 
131 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  50.37 
 
 
147 aa  126  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  43.2 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  39.2 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  34.48 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  38.17 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  31.93 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 
131 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  31.25 
 
 
171 aa  60.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  27.78 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6461  hypothetical protein  31.62 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  28.21 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3733  hypothetical protein  28.47 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  26.24 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1709  hypothetical protein  26.8 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1957  hypothetical protein  27.27 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  33.59 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  24.77 
 
 
194 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  30.33 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2261  hypothetical protein  23.53 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  30.21 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4177  hypothetical protein  20.47 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2083  hypothetical protein  26.95 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4686  hypothetical protein  23.62 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  29.69 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>