13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3733 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3733  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  317  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  31.9 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  32.04 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  29.17 
 
 
151 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  28.47 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  29.57 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  27.2 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  29.75 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4177  hypothetical protein  29.67 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1957  hypothetical protein  25.81 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  28.81 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  23.62 
 
 
194 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  26.17 
 
 
143 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>