17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7476 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  100 
 
 
143 aa  293  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4177  hypothetical protein  32.48 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  32.82 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  32.52 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  33.05 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  31.85 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  26.81 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  33.59 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  33.59 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  32.81 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6461  hypothetical protein  31.97 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  26.45 
 
 
171 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  30.08 
 
 
287 aa  43.5  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  30.51 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  24.24 
 
 
145 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3733  hypothetical protein  26.17 
 
 
152 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  28.81 
 
 
143 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>