23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4177 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4177  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  274  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  32.48 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  30.84 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  30.17 
 
 
141 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  31.19 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09480  phenazine biosynthesis protein  26.09 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  26.15 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0888  phenazine biosynthesis protein  26.09 
 
 
335 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  22.12 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1568  phenazine biosynthesis protein A/B  29.63 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108852  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  28 
 
 
171 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3733  hypothetical protein  29.67 
 
 
152 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39970  phenazine biosynthesis protein  24.64 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3385  phenazine biosynthesis protein  24.64 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3634  protein of unknown function DUF1486  27.2 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5028  Phenazine biosynthesis protein A/B  32.31 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.725966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  20.47 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4484  hypothetical protein  23.48 
 
 
140 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.320998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1957  hypothetical protein  25 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  20.47 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4426  hypothetical protein  27.52 
 
 
141 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0430646  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  21.6 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  25.22 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>