30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2983 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  100 
 
 		 131 aa  267  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  41.9 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  35.11 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  35.66 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  35.04 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  37.61 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  35.51 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3220  hypothetical protein  35.66 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4940  hypothetical protein  35.66 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4686  hypothetical protein  30.08 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  34.55 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6461  hypothetical protein  35.09 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3733  hypothetical protein  32.04 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4177  hypothetical protein  31.19 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  34.86 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  35.4 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  29.11 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1957  hypothetical protein  26.42 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4484  hypothetical protein  28.33 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.320998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  29.09 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5165  nuclear transport factor 2  30.83 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4426  hypothetical protein  32.46 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0430646  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  31.07 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  30.51 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  29.29 
 
 		 143 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1709  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1592  nuclear transport factor 2  29.51 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>