20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4413 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1957  hypothetical protein  55.56 
 
 		 182 aa  210  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4686  hypothetical protein  26.43 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  33.04 
 
 		 147 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  28.04 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  26.09 
 
 		 141 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  29.11 
 
 		 131 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  29.09 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  31.94 
 
 		 143 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  24.77 
 
 		 131 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  24.77 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  28.43 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1709  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5298  hypothetical protein  29.57 
 
 		 135 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  33.67 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  28.33 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3733  hypothetical protein  23.62 
 
 		 152 aa  42  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  32.1 
 
 		 153 aa  41.2  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>