27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2584 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  286  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  60.69 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  38.89 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  38.17 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  38.93 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  38.17 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  35.37 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  34.62 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  32.06 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2083  hypothetical protein  28.67 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  33.91 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6461  hypothetical protein  33.86 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  34.92 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  35.59 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  34.86 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  29.92 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  29.73 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  33.83 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5298  hypothetical protein  33.09 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1709  hypothetical protein  29.31 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39970  phenazine biosynthesis protein  25.95 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  28.33 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3385  phenazine biosynthesis protein  25.95 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4686  hypothetical protein  25 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4940  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1568  phenazine biosynthesis protein A/B  27.82 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108852  normal  0.0516478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>