12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5298 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5298  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  40.62 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6461  hypothetical protein  36.64 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  38.14 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  35.61 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  35.34 
 
 		 141 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1957  hypothetical protein  30.7 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  33.09 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  31.06 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  29.57 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  28.7 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>