37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4294 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  100 
 
 		 143 aa  290  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  57.5 
 
 		 125 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  35.66 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4940  hypothetical protein  38.46 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3220  hypothetical protein  38.46 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  33.85 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  30.17 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4686  hypothetical protein  26.95 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  34.07 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  33.33 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  29.92 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09470  phenazine biosynthesis protein  25.6 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39960  phenazine biosynthesis protein  26.61 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0888  phenazine biosynthesis protein  25.81 
 
 		 335 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294938  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3384  phenazine biosynthesis protein  26.61 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1568  phenazine biosynthesis protein A/B  28.46 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108852  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  28.43 
 
 		 194 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1957  hypothetical protein  31.73 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  32.11 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3385  phenazine biosynthesis protein  27.1 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  30.33 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  31.03 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5028  Phenazine biosynthesis protein A/B  25 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.725966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  27.97 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1709  hypothetical protein  24.56 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  30.33 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2518  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.56 
 
 		 426 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0714534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4417  nuclear transport factor 2  25.45 
 
 		 150 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39970  phenazine biosynthesis protein  26.17 
 
 		 162 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  28.81 
 
 		 143 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09480  phenazine biosynthesis protein  26.17 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3741  hypothetical protein  51.52 
 
 		 33 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.611696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  27.1 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4177  hypothetical protein  25.22 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  27.13 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>