17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1709 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1709  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  318  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  82.01 
 
 
145 aa  217  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  30.4 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  31.78 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  26.8 
 
 
131 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  30.34 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  26.8 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  26.8 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  38.46 
 
 
194 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  29.31 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  26.32 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  24.56 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0884  hypothetical protein  61.29 
 
 
31 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  32.26 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  28.57 
 
 
131 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1079  hypothetical protein  28.95 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.117657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  28.18 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>