20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1489 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  298  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1709  hypothetical protein  81.43 
 
 		 151 aa  233  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  31.25 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  33.67 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  32.46 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  30.48 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  30.33 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  27.78 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  28.7 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  27.78 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  30.53 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1079  hypothetical protein  28.83 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.117657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  29.21 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0884  hypothetical protein  67.74 
 
 		 31 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  27.97 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  22.64 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3634  protein of unknown function DUF1486  26.79 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  24.49 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  21.62 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  32.93 
 
 		 137 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>