23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3008 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  264  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  99.24 
 
 		 151 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  97.69 
 
 		 151 aa  259  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  50 
 
 		 147 aa  123  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  43.2 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  39.32 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  34.48 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  38.93 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  31.93 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  33.33 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  31.25 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  29.06 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6461  hypothetical protein  31.62 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1709  hypothetical protein  26.8 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1957  hypothetical protein  26.83 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  28.07 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3733  hypothetical protein  29.75 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  32.81 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  24.77 
 
 		 194 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  28.57 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  31.03 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4686  hypothetical protein  24.35 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>