26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3328 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  303  7e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  60.69 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  46.83 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  43.2 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  43.2 
 
 		 131 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  43.2 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  36.97 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  34.82 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  37.39 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6461  hypothetical protein  39.45 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2083  hypothetical protein  33.83 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5298  hypothetical protein  38.14 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  30.33 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  34.55 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  38.83 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  29.84 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  32.74 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  36.07 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  26.81 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  32.11 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1610  protein of unknown function DUF1486  36.07 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.692563  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3733  hypothetical protein  28.81 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4686  hypothetical protein  26.85 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4177  hypothetical protein  21.6 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  32.1 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1709  hypothetical protein  28.18 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>