14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4686 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4686  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  310  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1957  hypothetical protein  29.29 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4413  hypothetical protein  26.43 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  29.46 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  30.08 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4294  putative phenazine biosynthesis protein  26.95 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762733  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  28.69 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  31.58 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  26.98 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  26.85 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  23.62 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  24.35 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  29.82 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>