17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6461 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6461  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  293  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0569  phenazine biosynthesis protein  46.51 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5298  hypothetical protein  36.64 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5173  hypothetical protein  36.72 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0013731  hitchhiker  0.00383993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1346  hypothetical protein  34.92 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.199001  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3328  hypothetical protein  39.45 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0918311  normal  0.125783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6124  hypothetical protein  38.93 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532323  hitchhiker  0.00265373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2584  hypothetical protein  33.86 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2983  phenazine biosynthesis protein  35.09 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.543755  hitchhiker  0.00301559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20960  putativ isomerase  31.86 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3023  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.109621  normal  0.240834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3008  hypothetical protein  31.62 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3054  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0092  hypothetical protein  30.97 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  28.57 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  25 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7476  Limonene-12-epoxide hydrolase  31.97 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0495264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>