36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0376 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  100 
 
 
137 aa  279  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1423  Limonene-12-epoxide hydrolase  42.06 
 
 
133 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  37.5 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3634  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1640  hypothetical protein  29.2 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0534707  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  32.77 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  32.77 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  32.77 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1696  hypothetical protein  31.25 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.661261  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2898  ketosteroid isomerase-like protein  28.7 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3358  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  29.59 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2529  hypothetical protein  28.24 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4363  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  29.9 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  28.57 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1891  hypothetical protein  29.47 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.239366  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4426  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0430646  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  29.31 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  29.31 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  29.31 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  26.79 
 
 
145 aa  47.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0681  protein of unknown function DUF1486  30.25 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2428  protein of unknown function DUF1486  25.38 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000117407  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5451  hypothetical protein  29.21 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454717  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  33.65 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  29.41 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1210  ketosteroid isomerase-like protein  27.84 
 
 
167 aa  43.5  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.187179  normal  0.389634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10142  hypothetical protein  34.43 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02403  hypothetical protein  28.57 
 
 
284 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0113  ketosteroid isomerase-like protein  27.08 
 
 
212 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1979  hypothetical protein  31.82 
 
 
126 aa  41.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  26.92 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1102  hypothetical protein  25.42 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  31.11 
 
 
359 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10033  hypothetical protein  31.62 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.505425  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4455  hypothetical protein  21.37 
 
 
133 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00728283  normal  0.540789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1489  hypothetical protein  32.93 
 
 
145 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>