14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1891 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1891  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  283  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.239366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3358  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  66.17 
 
 		 141 aa  190  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0113  ketosteroid isomerase-like protein  56.15 
 
 		 212 aa  169  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1469  hypothetical protein  55.73 
 
 		 175 aa  161  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1210  ketosteroid isomerase-like protein  52.34 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.187179  normal  0.389634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5451  hypothetical protein  50.39 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4363  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  44.88 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2898  ketosteroid isomerase-like protein  45.45 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02403  hypothetical protein  40.94 
 
 		 284 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3634  protein of unknown function DUF1486  35.29 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1640  hypothetical protein  28.93 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0534707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1969  hypothetical protein  29.51 
 
 		 141 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  29.47 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  25.83 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>