47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1634 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  260  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  46.4 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  33.33 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  32.56 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718505 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4449  hypothetical protein  31.45 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal  0.0764315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  31.97 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  32.77 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2225  hypothetical protein  27.78 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  33.86 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3975  hypothetical protein  29.66 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  27.87 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3291  hypothetical protein  33.06 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1836  hypothetical protein  33.06 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0273  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2716  hypothetical protein  33.06 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374987  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  31.75 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0051  hypothetical protein  32.26 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41030  hypothetical protein  31.45 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0059  hypothetical protein  32.26 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.75 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0058  hypothetical protein  32.26 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  26.61 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.75 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6122  hypothetical protein  30.95 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  30.08 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4942  hypothetical protein  28.03 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0827  hypothetical protein  29.69 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.348672  unclonable  0.00000936825 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  32.54 
 
 		 1420 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2428  protein of unknown function DUF1486  27.19 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000117407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  29.03 
 
 		 287 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4455  hypothetical protein  24.6 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00728283  normal  0.540789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  33.9 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  33.9 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  33.9 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0880  hypothetical protein  23.81 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0737  hypothetical protein  23.33 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00542043  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1094  hypothetical protein  27.27 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3358  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  24.17 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4426  hypothetical protein  44.9 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0430646  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  32.2 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  32.2 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  32.2 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0922  hypothetical protein  20.97 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56602e-43 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1891  hypothetical protein  25.83 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.239366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>