53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3498 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  283  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3975  hypothetical protein  41.41 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  39.32 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  30.77 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3109  hypothetical protein  30.33 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.662337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  27.42 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  29.6 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  28.1 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  30.95 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1094  hypothetical protein  27.13 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  30.16 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0063  hypothetical protein  29.92 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  29.66 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  24.6 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7393  hypothetical protein  31.97 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  29.6 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  28.03 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5975  hypothetical protein  30.7 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4622  hypothetical protein  22.83 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  26.13 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4942  hypothetical protein  27.27 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4455  hypothetical protein  25.26 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00728283  normal  0.540789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  26.23 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  27.2 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0736  hypothetical protein  21.6 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116792  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  28.68 
 
 		 1420 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  27.2 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0880  hypothetical protein  24.21 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  24.59 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0991  hypothetical protein  21.6 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00914554  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1877  hypothetical protein  23.85 
 
 		 519 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0922  hypothetical protein  21.26 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56602e-43 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  26.92 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5252  hypothetical protein  28.95 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0723  hypothetical protein  21.26 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000344598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0917  hypothetical protein  20.49 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000348146  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4449  hypothetical protein  29.66 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal  0.0764315 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  26.92 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3167  hypothetical protein  28.09 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169208  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  26.92 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4844  hypothetical protein  23.33 
 
 		 162 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3310  hypothetical protein  28.09 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9084  hypothetical protein  26.83 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3166  hypothetical protein  28.09 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2716  hypothetical protein  28.95 
 
 		 130 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0737  hypothetical protein  23.16 
 
 		 134 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00542043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3291  hypothetical protein  28.95 
 
 		 130 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4808  limonene-1,2-epoxide hydrolase  23.01 
 
 		 130 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1836  hypothetical protein  28.95 
 
 		 130 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0681  protein of unknown function DUF1486  26.45 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2785  ketosteroid isomerase-like protein  23.7 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00716853  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0281  hypothetical protein  27.37 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.106123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0273  hypothetical protein  27.5 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>