51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4449 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4449  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  266  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal  0.0764315 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0273  hypothetical protein  62.02 
 
 
139 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2716  hypothetical protein  61.24 
 
 
130 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1836  hypothetical protein  61.24 
 
 
130 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3291  hypothetical protein  61.24 
 
 
130 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0058  hypothetical protein  61.24 
 
 
130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0059  hypothetical protein  61.24 
 
 
130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0051  hypothetical protein  59.69 
 
 
139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41030  hypothetical protein  52.71 
 
 
129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  47.29 
 
 
130 aa  124  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2225  hypothetical protein  42.31 
 
 
131 aa  114  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2785  ketosteroid isomerase-like protein  40.32 
 
 
165 aa  103  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00716853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  36.89 
 
 
130 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3310  hypothetical protein  41.46 
 
 
156 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0737  hypothetical protein  33.08 
 
 
134 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00542043  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3167  hypothetical protein  40.65 
 
 
156 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0991  hypothetical protein  33.08 
 
 
133 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00914554  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3166  hypothetical protein  41.46 
 
 
156 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55884  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1204  ketosteroid isomerase-related protein  41.53 
 
 
156 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0307443  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0736  hypothetical protein  33.08 
 
 
133 aa  100  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0922  hypothetical protein  32.31 
 
 
133 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56602e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4455  hypothetical protein  33.85 
 
 
133 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00728283  normal  0.540789 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0827  hypothetical protein  32.31 
 
 
133 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000717124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0787  hypothetical protein  32.31 
 
 
133 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0723  hypothetical protein  32.31 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000344598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0917  hypothetical protein  31.54 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000348146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0880  hypothetical protein  32.31 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0281  hypothetical protein  37.27 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.106123  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5481  hypothetical protein  38.18 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4379  hypothetical protein  36.36 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.73238e-23 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0063  hypothetical protein  30.65 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  33.86 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  32.54 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  31.45 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  36.29 
 
 
359 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  30.51 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  33.07 
 
 
131 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  32.28 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  33.85 
 
 
1420 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5975  hypothetical protein  33.04 
 
 
132 aa  57.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4808  limonene-1,2-epoxide hydrolase  32.14 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  28.46 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  28.12 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3634  protein of unknown function DUF1486  28 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1547  hypothetical protein  29.13 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.296698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1094  hypothetical protein  27.5 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  29.66 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.718505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  31.91 
 
 
137 aa  42  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  25.6 
 
 
287 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3109  hypothetical protein  30.77 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.662337  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4622  hypothetical protein  25.6 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>