45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1111 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  264  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  46.4 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  43.7 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  39.32 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  36.67 
 
 		 359 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  29.17 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  31.09 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  31.62 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  32.2 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  33.87 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4808  limonene-1,2-epoxide hydrolase  34.17 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1094  hypothetical protein  32.2 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3975  hypothetical protein  29.46 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2428  protein of unknown function DUF1486  32.2 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000117407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.45 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  30.51 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  32.48 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3109  hypothetical protein  30.58 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.662337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  33.05 
 
 		 1420 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4622  hypothetical protein  32 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  33.9 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4942  hypothetical protein  31.48 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  28.85 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41030  hypothetical protein  30.08 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1547  hypothetical protein  29.92 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0063  hypothetical protein  27.87 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  28.21 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4019  hypothetical protein  33.04 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9084  hypothetical protein  30.7 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4449  hypothetical protein  28.46 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal  0.0764315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2650  protein of unknown function DUF1486  27.2 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.679819 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2716  hypothetical protein  29.91 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1836  hypothetical protein  29.91 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3291  hypothetical protein  29.91 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0051  hypothetical protein  29.91 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0273  hypothetical protein  29.91 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0058  hypothetical protein  29.06 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0059  hypothetical protein  29.06 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2898  ketosteroid isomerase-like protein  25.81 
 
 		 153 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0827  hypothetical protein  24.03 
 
 		 145 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.348672  unclonable  0.00000936825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6122  hypothetical protein  24.8 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0880  hypothetical protein  21.01 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4455  hypothetical protein  21.01 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00728283  normal  0.540789 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  27.68 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>