57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1094 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1094  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  268  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  77.52 
 
 
138 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  66.67 
 
 
137 aa  184  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  66.41 
 
 
137 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  42.42 
 
 
134 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  41.67 
 
 
134 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  27.34 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  31.25 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  32.2 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  27.87 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.718505 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  28.46 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41030  hypothetical protein  31.97 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  28.46 
 
 
359 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  28.12 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  32.82 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  32.82 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  32.82 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  28 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  27.34 
 
 
131 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4622  hypothetical protein  26.52 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4808  limonene-1,2-epoxide hydrolase  27.52 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  28.1 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  35.11 
 
 
1420 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  26.42 
 
 
287 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1423  Limonene-12-epoxide hydrolase  31.11 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4449  hypothetical protein  27.5 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal  0.0764315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3975  hypothetical protein  24.6 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289621  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4942  hypothetical protein  25.76 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0051  hypothetical protein  27.42 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9084  hypothetical protein  28.33 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1696  hypothetical protein  23.97 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.661261  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2785  ketosteroid isomerase-like protein  23.85 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00716853  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3310  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1204  ketosteroid isomerase-related protein  25.19 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0307443  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10033  hypothetical protein  24.37 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.505425  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2529  hypothetical protein  24.09 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  34.92 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1547  hypothetical protein  25 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.296698 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  34.92 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  34.92 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1506  hypothetical protein  25.2 
 
 
145 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3629  hypothetical protein  37.1 
 
 
141 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.456472  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3166  hypothetical protein  24.8 
 
 
156 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55884  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0273  hypothetical protein  25.81 
 
 
139 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739409  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  27.05 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0681  protein of unknown function DUF1486  30.38 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0737  hypothetical protein  21.37 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00542043  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3167  hypothetical protein  24.22 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  25.2 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0058  hypothetical protein  25.81 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0059  hypothetical protein  25.81 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3109  hypothetical protein  25.19 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.662337  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2898  ketosteroid isomerase-like protein  23.68 
 
 
153 aa  40.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2716  hypothetical protein  25 
 
 
130 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0880  hypothetical protein  19.85 
 
 
133 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1836  hypothetical protein  25 
 
 
130 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3291  hypothetical protein  25 
 
 
130 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>