23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3629 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3629  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  280  7.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.456472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9084  hypothetical protein  33.86 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5659  putative ketosteroid isomerase-related protein  38.28 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0728  hypothetical protein  38.4 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2092  hypothetical protein  34.4 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390718  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10033  hypothetical protein  34.71 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.505425  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  29.2 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  29.2 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  29.2 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2116  protein of unknown function DUF1486  30.97 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0822  hypothetical protein  34.38 
 
 
135 aa  50.4  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1451  hypothetical protein  34.38 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  26.72 
 
 
359 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  25.86 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  25.86 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  25.86 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2606  hypothetical protein  32.35 
 
 
228 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000194821  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  25.83 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3358  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  28 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  29.82 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  30.67 
 
 
287 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  30.89 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14130  hypothetical protein  32.79 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0339955  normal  0.12705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>