15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2116 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2116  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 129 aa  264  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1102  hypothetical protein  37.1 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1451  hypothetical protein  39.68 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0822  hypothetical protein  38.89 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10033  hypothetical protein  29.92 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.505425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0728  hypothetical protein  32.17 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2092  hypothetical protein  28.33 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9084  hypothetical protein  28.35 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3629  hypothetical protein  30.97 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.456472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5659  putative ketosteroid isomerase-related protein  28.69 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3428  limonene-1,2-epoxide hydrolase  27.27 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  26.77 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  39.29 
 
 		 131 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  39.29 
 
 		 131 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  39.29 
 
 		 131 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>