48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3358 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  266  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  266  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  266  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  72.09 
 
 
130 aa  204  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  72.09 
 
 
130 aa  204  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  72.09 
 
 
130 aa  204  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1451  hypothetical protein  45.76 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0822  hypothetical protein  45.76 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0681  protein of unknown function DUF1486  33.6 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3629  hypothetical protein  29.2 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.456472  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  31.2 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  30.4 
 
 
131 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  31.75 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1067  hypothetical protein  30.77 
 
 
116 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  31.25 
 
 
1420 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4499  hypothetical protein  28.7 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  26.98 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  28.12 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  29.6 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10033  hypothetical protein  29.37 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.505425  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  29.31 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  38.1 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  28.8 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1102  hypothetical protein  27.82 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0728  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1423  Limonene-12-epoxide hydrolase  26.83 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  28 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  30.47 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0816  hypothetical protein  28.85 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403469  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41030  hypothetical protein  29.41 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  36.36 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3483  protein of unknown function DUF1486  28.44 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5659  putative ketosteroid isomerase-related protein  28.03 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9084  hypothetical protein  35.94 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  32 
 
 
288 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3519  hypothetical protein  25.56 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5451  hypothetical protein  29.66 
 
 
165 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454717  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3358  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  27.18 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  29.03 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  32.2 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1469  hypothetical protein  26.89 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.716507  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3975  hypothetical protein  25.41 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289621  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2428  protein of unknown function DUF1486  26.19 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000117407  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  26.36 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4024  hypothetical protein  38.3 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000625612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  40.43 
 
 
253 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3634  protein of unknown function DUF1486  29.41 
 
 
143 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2116  protein of unknown function DUF1486  39.29 
 
 
129 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>