22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4024 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4024  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  247  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000625612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0119  hypothetical protein  42.06 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1549  hypothetical protein  39.25 
 
 
217 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245035  normal  0.421629 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0226  hypothetical protein  36.84 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0662  hypothetical protein  42.99 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0501  hypothetical protein  42.99 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.89732  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4124  hypothetical protein  32.2 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4101  hypothetical protein  34.26 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0751717  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0222  hypothetical protein  35.09 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.958256  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0943  hypothetical protein  34.21 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1231  hypothetical protein  34.21 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2206  hypothetical protein  34.21 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1929  hypothetical protein  34.21 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0312  hypothetical protein  34.21 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0187  hypothetical protein  33.66 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255272  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1675  hypothetical protein  34.21 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2614  hypothetical protein  29.73 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1443  hypothetical protein  28.92 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0357  hypothetical protein  42.86 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  38.3 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  38.3 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  38.3 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>