23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4124 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4124  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  256  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1443  hypothetical protein  44.17 
 
 
125 aa  97.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4101  hypothetical protein  40.17 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0751717  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0119  hypothetical protein  38.98 
 
 
119 aa  82  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2614  hypothetical protein  38.39 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4024  hypothetical protein  32.2 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000625612  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1549  hypothetical protein  35.71 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245035  normal  0.421629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0501  hypothetical protein  33.62 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.89732  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0662  hypothetical protein  33.62 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0226  hypothetical protein  31.4 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0312  hypothetical protein  33.61 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1675  hypothetical protein  33.61 
 
 
171 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0187  hypothetical protein  30.7 
 
 
114 aa  60.1  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255272  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1929  hypothetical protein  31.97 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2206  hypothetical protein  31.97 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1231  hypothetical protein  31.97 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0943  hypothetical protein  31.97 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0222  hypothetical protein  32.23 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.958256  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6918  hypothetical protein  25 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  36.51 
 
 
145 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6302  hypothetical protein  30.43 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141026  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  27.18 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1777  hypothetical protein  32.71 
 
 
148 aa  40  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>