18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1777 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1777  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1775  hypothetical protein  33.6 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4832  hypothetical protein  30.1 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1423  hypothetical protein  33.68 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635481  normal  0.372095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4153  hypothetical protein  28.87 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3993  hypothetical protein  30.36 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  28 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  28 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  31.67 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4942  hypothetical protein  22.73 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  26.67 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  41.38 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  22.13 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  29.6 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  29.6 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  29.6 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1696  hypothetical protein  22.22 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.661261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4124  hypothetical protein  32.71 
 
 		 124 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>