68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5869 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
138 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  77.04 
 
 
137 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  73.68 
 
 
137 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1094  hypothetical protein  77.52 
 
 
131 aa  202  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  39.69 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  38.93 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  33.59 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  26.56 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1111  hypothetical protein  32.2 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4808  limonene-1,2-epoxide hydrolase  29.36 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  27.87 
 
 
359 aa  62  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  30.71 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  28.1 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.718505 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4942  hypothetical protein  28.12 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  28.12 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4622  hypothetical protein  28.36 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3418  hypothetical protein  32.31 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451707  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3367  hypothetical protein  32.31 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3356  hypothetical protein  32.31 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  27.13 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3975  hypothetical protein  27.34 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289621  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41030  hypothetical protein  31.2 
 
 
129 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1645  limonene-1,2-epoxide hydrolase catalytic domain-contain protein  26.92 
 
 
1420 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  26.36 
 
 
131 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  30.16 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1634  hypothetical protein  30.08 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347419  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0736  hypothetical protein  23.66 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116792  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2785  ketosteroid isomerase-like protein  25.78 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00716853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1423  Limonene-12-epoxide hydrolase  32.56 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  23.64 
 
 
287 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  27.01 
 
 
138 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1204  ketosteroid isomerase-related protein  24.22 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0307443  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3166  hypothetical protein  23.44 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55884  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4449  hypothetical protein  28.12 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal  0.0764315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0880  hypothetical protein  22.9 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3310  hypothetical protein  23.44 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0917  hypothetical protein  22.73 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000348146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0681  protein of unknown function DUF1486  31.45 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5975  hypothetical protein  27.2 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3358  hypothetical protein  30.47 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.8978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3420  hypothetical protein  30.47 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.326133  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3369  hypothetical protein  30.47 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.915691  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3167  hypothetical protein  23.81 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0737  hypothetical protein  24.26 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00542043  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1696  hypothetical protein  22.22 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.661261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0051  hypothetical protein  28.23 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0922  hypothetical protein  23.66 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56602e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0723  hypothetical protein  24.43 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000344598  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0991  hypothetical protein  22.9 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00914554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4455  hypothetical protein  22.14 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00728283  normal  0.540789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0063  hypothetical protein  26.32 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0787  hypothetical protein  22.9 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185492  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0816  hypothetical protein  27.42 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403469  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0827  hypothetical protein  22.9 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000717124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1777  hypothetical protein  26.67 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254944  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0273  hypothetical protein  27.42 
 
 
139 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739409  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2529  hypothetical protein  24.62 
 
 
134 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6122  hypothetical protein  23.33 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2898  ketosteroid isomerase-like protein  25.23 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3126  hypothetical protein  45.24 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  26.92 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3483  protein of unknown function DUF1486  27.13 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2116  protein of unknown function DUF1486  26.77 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0058  hypothetical protein  26.83 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0059  hypothetical protein  26.83 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2716  hypothetical protein  26.61 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1836  hypothetical protein  26.61 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3291  hypothetical protein  26.61 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>